忽必烈之子忽时升统治后，元朝逐渐衰弱，至至大四年（1368年），明太祖朱元璋攻占大都，建立明朝，从而结束了元朝的统治。
在这个过程中，有几个关键因素导致了元朝灭亡：
政治腐败：从忽必烈时代开始，一直到末代皇帝图帖目，这段时间里，政府内部存在严重的腐败现象。官员贪污、滥用职权成为常态，大多数税收被地方官员私吞，而不是用于国家建设和人民福利。这不仅削弱了中央集权，还引起民众对政府的强烈不满。
内部矛盾：随着时间的推移，不同族群之间以及不同地区之间出现了一系列矛盾。蒙古贵族与汉人间的民族矛盾加剧，同时各地豪杰们也在争夺地方势力，与中央政权产生冲突。这种内部分裂严重削弱了整个帝国的凝聚力。
经济困境：战争消耗巨大，加上自然灾害频发，使得经济形势日益恶化。农民负担过重，许多人逃离乡村投身于反抗军中或是流落他乡，这进一步减少了国家征税能力和人口基数，对国家财政造成重大打击。
军事问题：由于长期战乱导致士气低落和训练不足，当面临外敌入侵时，即使有庞大的军队，也难以有效抵御。在红巾军起义期间，由于缺乏有效指挥和组织，上层领导者无法迅速镇压下层暴动，最终失去了控制局面的能力。
地方割据：随着中央力量衰退，一些地方豪强崛起，他们自行设置封建领地，并且独立行事。而这些割据势力往往互相竞争甚至结盟对抗中央政府，使得整个国家陷入分裂状态，不再是一个统一体制下的整体存在。
明清交替：最终，在明太祖朱元璋领导下的红巾军将剩余的蒙古残兵赶出了中国北方，将其驱逐出亚洲历史舞台。这标志着一个新的王朝——明朝成立，同时也意味着元朝彻底走向覆灭，其遗存被边缘化并逐渐消融进历史尘埃中。
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