兵力削弱与中央集权衰退
明朝在长期战争中消耗了大量的人力和物资，尤其是对抗倭寇、蒙古等外敌的战事，以及内部所谓“三大战役”（攻打李自成、张献忠和王凤翔）也极大地削弱了国家实力的同时，中央集权制度由于无法有效地调动资源，也导致地方势力的崛起。明政府为了解决财政问题，不得不采取增税和减俸等措施，这些政策激发了人民的不满，加速了社会矛盾的积累。
官僚腐败与特权阶层固化
明代官僚体系虽然名义上强调科举选拔，但实际上家族背景、世袭以及贿赂等因素影响着仕途，因此形成了一种官本位思想，使得官员们更多关注的是维护自己的利益而非国家发展。这种腐败现象严重损害了国家治理能力，并且加剧了社会经济上的不平衡。同时，由于军功爵位制度的存在，一些将领通过征战获得的地盘转化为私人势力，这进一步削弱了皇帝对地方军队指挥权，从而使中央对全局失去控制。
农业危机与农民起义
随着人口增加和耕地有限，土地分配问题成为主要矛盾之一。加之天灾频发，如洪水、旱灾等自然灾害，再加上农业生产技术落后，都导致粮食产量下降。这直接推动了一系列农民起义，最著名的是李自成领导的大顺农民军，他们攻破北京，对明朝造成巨大的威胁。此类事件不断发生，无疑是明朝灭亡的一个重要原因。
外患压迫与国防体系脆弱
从努尔哈赤建立后的后金到清初统一中国，满洲族逐渐构成了一个强大的民族力量，其边境冲突不断侵蚀着东北边疆地区。而另一方面，由于缺乏有效的防御策略及科技创新，加之内忧不断，使得明朝在面对外来威胁时表现出较低效率。在1644年多尔衷入关前夕，即使有孙承宗收复失地的一段时间，但整体来说，国防体系仍然显得脆弱无力。
文化衰退与学术界隔阂
明代文化虽然在绘画、书法艺术领域取得辉煌成就，但是在科学研究和哲学思潮方面却显著落后于其他文明，如日本、三佛齐甚至欧洲各国都在这些领域有所建树。更糟糕的是，在学术界出现了一种排他性的争鸣模式，其中一些派别相互排斥，没有形成融合学习共享知识的良好环境。此外，与前此盛行的情理文学相比，政治理论对于改善社会状况几乎毫无帮助，这也是社会改革受阻的一个重要原因。
